main:移除 src 目录结构，更新模块引用路径

变更内容：
- 删除 `src` 子目录，将模块引用路径从 `src.functional_scaffold` 更新为 `functional_scaffold`。
- 修改相关代码、文档、测试用例及配置文件中的路径引用，包括 `README.md`、`Dockerfile`、`uvicorn` 启动命令等。
- 优化项目目录结构，提升代码维护性和可读性。

scripts/run_dev.sh

@@ -21,4 +21,4 @@ pip install -e ".[dev]"
 # 启动服务
 echo "Starting server on http://localhost:8000"
 echo "API docs available at http://localhost:8000/docs"
-uvicorn src.functional_scaffold.main:app --reload --host 0.0.0.0 --port 8000
+uvicorn functional_scaffold.main:app --reload --host 0.0.0.0 --port 8000