main:移除 src 目录结构，更新模块引用路径

变更内容：
- 删除 `src` 子目录，将模块引用路径从 `src.functional_scaffold` 更新为 `functional_scaffold`。
- 修改相关代码、文档、测试用例及配置文件中的路径引用，包括 `README.md`、`Dockerfile`、`uvicorn` 启动命令等。
- 优化项目目录结构，提升代码维护性和可读性。

pyproject.toml

@@ -48,3 +48,4 @@ python_files = ["test_*.py"]
 python_classes = ["Test*"]
 python_functions = ["test_*"]
 addopts = "-v --strict-markers"
+pythonpath = ["src"]